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El microscopio biológico puede tener la cabeza monocular ó binocular. Proporciona altos aumentos y permite observar preparados, secciones de órganos ó tejidos en un cristal transparente, de modo que son atravesados por la luz. En este tipo de microscopio la luz atraviesa la muestra. Por ello, este tipo de microscopio está provisto de iluminador con luz trasmitida, es decir desde abajo ó de espejo para condensar la luz solar. En general este es el sistema de iluminación más utilizado entre los microscopios ópticos.
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